Edyを利用してNetで買い物するときにAppletが起動しますが、EdyLibrary.dllを経由してパソリと通信しているんですね。通常Appletは、JNIを呼ぶことはできないんですがsigned Applet化することでJNIを利用することができるようです。長い間勘違いしていました…